自动化专业前身是1952年建校时设置的电机专业，1962年工业企业自动化专业开始招生，1988年更名为自动化专业，目前在校本科生500人。经过60年的发展与建设，自动化专业先后获得吉林省特色专业、吉林省品牌专业、吉林省一流本科专业、吉林省特色高水平专业、国家级特色专业、国家级综合改革试点专业，2019年12月被评为首批国家级一流本科专业建设点。建有国家级精品课程、国家级精品资源共享课程、省级精品课程、省级优秀课程、省级精品在线开放课程多门，2020年11月《计算机控制系统》课程被评为国家级一流本科课程。《计算机控制系统》教材为国家级规划教材、吉林省普通高等学校优秀教材。拥有国家级工程实践教育中心、省级实验教学示范中心、省级大学生科技创新实践示范基地。

自动化国家级教学团队现有专任教师27人，其中博士生导师7人，教授11人，副教授5人，博士20人，包括教育部自动化类专业教学指导委员会委员1人，吉林省长白山学者1人，吉林省教学名师1人，吉林省优秀教师1人，新世纪吉林省高等学校学科（专业）建设工程中青年骨干教师1人，吉林省跨世纪学术和技术带头人后备人选1人，吉林省拔尖创新人才3人，吉林省有突出贡献中青年专业技术人才3人。

专业建有自控原理、过程控制与仪表、计算机控制系统、机器人与运动控制、微机原理与应用、电力拖动控制系统等专业实验室，构建了“基础、专业、研究”三级实验室平台体系。电工电子基础实验教学中心（省级实验教学示范中心），为学生提供了先进的电类基础课程实验教学与工程训练平台；自动化及电气工程专业实验教学示范中心（省级实验教学示范中心）与中国自动化学会、西门子（中国）工控公司联合成立自动化系统工程师认证（ASEA）中心，为学生提供了专业技能训练平台；长春工业大学-中钢集团吉林铁合金股份有限公司工程实践教育中心（国家级工程实践教育中心）、智能测控大学生科技创新实践基地（省级大学生科技创新实践示范基地），为学生提供了工程实践能力、工程设计能力与工程创新能力训练平台。吉林省控制工程重点实验室等7个省级科研平台为师生科学研究和创新实践能力的培养提供了强有力支撑。

专业人才培养成效显著，毕业生受到社会的广泛认可和普遍赞誉，学生的就业率和考研录取率位居全校前列。本专业一直注重学生创新意识和科研能力的培养，近五年来，获中国智能制造挑战赛国家级特等奖1项、国家级二等奖1项，全国大学生电子设计竞赛省级一等奖4项、二等奖12项、三等奖12项，全国大学生机械创新设计大赛国家级二等奖2项、省级一等奖1项，全国大学生智能汽车竞赛国家级二等奖1项、省级一等奖2项、省级三等奖1项，省级以上大学生创新创业训练项目19项，吉林省高等学校机器人大赛省级一等奖8项、二等8项、三等奖4项。